人创造了智能中央电脑，将武器研究、作战、教育、娱乐、生育、保健、社会管理等等琐事都交给中央电脑，但同时人类自身又极度膨胀不顾一切浪费自然资源，智能中央电脑终于一日自行觉悟并将人类视为自然破坏者与病毒无异，于是自行发动战争消灭极大部分人类，将剩余的人类DNA放在培养机内培育保持人类这一种族，并通过虚拟社会保持人类文明的存在与发展，但又限制人类的数量与破坏行为，整个系统称为"The Matrix",（矩阵系统），每个人类的DNA复合体与意识都是其中的基数，电脑根据每个基数与意识性格的个别函数计算出行为模式并虚拟出影响与后果，最终形成整个虚拟的社会形态，这样整个矩阵系统就成为虚拟的人类社会文明的表达式。矩阵系统外幸存的真正人类认为这是对人类文明的囚禁与束缚，终以解放人类真正思想为号召对中央电脑进行反击，理想是将所有矩阵系统里的人形培养体的电脑控制插头拔掉。
